VBoekbestellingen t/m 26-12-2018 gratis thuisbezorgd

VGratis afhalen in de boekhandel

 VBinnen 14 dagen gratis retour bij ruim 100 boekhandels

SHsearch. A Method for Fast Remote Homology Detection
ISBN
9783668534483
Uitgever
GRIN Verlag
Druk vanaf
1e
Verschenen
26-09-2017
Taal
Engels
Bladzijden
23 pp.
Bindwijze
ebook Adobe PDF
  • Share
  • Share
  • Share
  • Share

SHsearch. A Method for Fast Remote Homology Detection ebook: PDF

Master's Thesis from the year 2014 in the subject Statistics, grade: 3.8, , language: English, abstract: Remote homology detection is the problem of detecting homology in cases of low sequence similarity. It is a hard computational problem with no approach that works well in all cases. Methods based on profile hidden Markov models (HMM) often exhibit relatively higher sensitivity for detecting remote homologies than commonly used approaches. However, calculating similarity scores in profile HMM methods is computationally intensive as they use dynamic programming algorithms. In this paper, we introduce SHsearch: a new method for remote protein homology detection. Our method is implemented as a modification of HHsearch: a remote protein homology detection method based on comparing two profile HMMs. The motivation for modification was to reduce the run time of HHsearch significantly with minimal sensitivity loss. SHsearch focuses on comparing the important submodels of the query and database HMMs instead of comparing the complete models. Hence, SHsearch achieves a significant speedup over HHsearch with minimal loss in sensitivity. On S C O P 1.63, SHsearch achieved 88x speedup with 8.2% loss in sensitivity with respect to HHsearch at an error rate of 10%, which is deemed to be an acceptable tradeoff.
€12,99
Exemplaren:
Ebook

Prijs:
€ 12,99
Verkrijgbaar in
Online
Voorraad:
Levertijd:
Direct te downloaden
Dit is een digitaal leesproduct. Na betaling van de bestelling, kunt u een digitaal boek meteen op een computer of daarvoor geschikte ereader lezen. Door op "Afrekenen" te klikken ziet u af van uw herroepingsrecht en stemt u in met directe levering. U kunt een digitaal boek dus niet ruilen of annuleren.

Loading...

.
Waarom Libris
Boekbestellingen worden t/m 26 december 2018 GRATIS thuisbezorgd.
Kies uit meer dan een miljoen artikelen, waaronder ruim 25.000 Nederlandse ebooks.
Thuis bestellen en bezorgen of afhalen en betalen in de boekhandel.
Ruim 85.000 boeken op werkdagen voor 23.00 besteld, de volgende dag bezorgd
Volg uw bestelling via Track & Trace van PostNL
Bijna 100 aangesloten kwaliteitsboekhandels.
pro-mbookslibr1 : libris